动态图与系谱结构中等价关系的高效识别

Hoyt Koepke; Elizabeth Thompson

动态图与系谱结构中等价关系的高效识别

数据结构与算法 2013-02-20 v3 定量方法统计计算

作者: Hoyt Koepke , Elizabeth Thompson

摘要

我们提出了一个新的框架，用于为随给定参数（如遗传标记位置）变化的复杂结构设计测试与查询函数。我们感兴趣的操作包括相等性测试、集合操作、隔离唯一状态、重复计数，或在可识别性约束下寻找等价类。一个驱动性应用是在同源相同（IBD）图中定位等价类，IBD 图是系谱分析中随遗传标记位置变化的图结构。这些图的节点是无标记的，仅通过其连接边来识别，这一约束很容易被我们的方法处理。所引入的通用框架足够强大，能够使用最少的操作集为 IBD 图、动态种群和其他结构构建一系列测试函数。我们分析并证明了我们方法的理论与算法性质。在若干模拟上的计算结果证明了我们方法的有效性。

关键词

动态图系谱结构同源相同图等价类相等性测试查询函数

引用

@article{arxiv.1301.3946,
  title  = {Efficient Identification of Equivalences in Dynamic Graphs and Pedigree Structures},
  author = {Hoyt Koepke and Elizabeth Thompson},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1301.3946},
  year   = {2013}
}

备注

Code for paper available at http://www.stat.washington.edu/~hoytak/code/hashreduce

动态图与系谱结构中等价关系的高效识别

摘要

关键词

引用

备注

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