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强度标准化对多中心 FLAIR MRI 中基于深度学习的 WML 分割的影响

图像与视频处理 2023-07-11 v1 人工智能 计算机视觉与模式识别 机器学习 信号处理

摘要

用于 MRI 中白质病变(WML)分割的深度学习(DL)方法,在应用于与训练数据分布外(OOD)的扫描仪或中心数据时,性能会下降。这对于转化与广泛采用至关重要,因为当前模型无法轻易应用于来自新机构的数据。在这项工作中,我们评估了多种 MRI 强度标准化方法,作为多中心液体衰减反转恢复(FLAIR)MRI 中 WML 分割的预处理步骤。我们评估了一种专为 FLAIR MRI 开发的方法 IAMLAB,以及其他流行的归一化技术如 White-strip、Nyul 和 Z-score。我们提出了一种集成模型,结合了来自这些模型各自的预测。在标准化图像以及原始数据上训练了一个跳跃连接 UNet(SC UNet),并从多个维度评估了分割性能。训练(分布内)数据由单一研究、60 个体积组成,测试(OOD)数据为来自三个临床队列的 128 个未见过体积。结果显示,与来自原始数据或其他归一化方法的模型相比,IAMLAB 和集成提供了更高的 WML 分割性能。IAMLAB 与集成在分布内数据(0.78 与 0.80)和临床 OOD 数据上具有最高的骰子相似系数(DSC)。对于所有病变类别,IAMLAB 的 DSC 均显著高于原始数据(p<0.05)(LL>25mL:0.77 对 0.71;10mL<= LL<25mL:0.66 对 0.61;LL<10mL:0.53 对 0.52)。IAMLAB 和集成归一化方法正在缓解 MRI 域偏移,并且是针对未见过 FLAIR 数据中基于 DL 的 WML 分割的最优方法。

关键词

引用

@article{arxiv.2307.03827,
  title  = {Effect of Intensity Standardization on Deep Learning for WML Segmentation in Multi-Centre FLAIR MRI},
  author = {Abdollah Ghazvanchahi and Pejman Jahbedar Maralani and Alan R. Moody and April Khademi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2307.03827},
  year   = {2023}
}