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美国各州的动态聚类揭示四种预测 SARS-CoV-2 大流行行为的 distinct 感染模式

物理与社会 2021-12-14 v1 种群与进化

摘要

SARS-CoV-2 大流行迄今在美国五十个州中呈现出多样化态势,既反映于感染“波次”的不同时间进程,也反映于局部感染率的不同规模。尽管表现差异显著,多数美国州在 2020 年秋至 2021 年冬的过渡期经历了单日新增病例的最大激增。大众媒体亦援引各州间的额外相似性——往往不顾政府政策、报告戴口罩依从率及疫苗接种比例方面的差异。本文中,我们识别出一组稳健的低维聚类,其 1)概括了全部 50 个州可及的四次历史 COVID-19“波次机会”的时间与相对高度,2)与这些州组相关的地理和干预模式相关联,且 3)预测 2021 年夏末“第五波”新感染的部分特征。我们特别指出,聚类阐明了州组内疫苗接种率与后续病例负载变异性之间的负向关系。我们提出假设:疫苗接种犹如“安全带”,即便在 2021 年夏变异驱动激增的背景下,也实质上约束了新病例上升的可能范围。

关键词

引用

@article{arxiv.2112.05782,
  title  = {Dynamical clustering of U.S. states reveals four distinct infection patterns that predict SARS-CoV-2 pandemic behavior},
  author = {Joseph L. Natale and Varun Viswanath and Oscar Trujillo Acevedo and Sophia Pérez Giottonini and Sandy Ihuiyan Romero Hernández and Diana G. Cruz Millán and A. Montserrat Palacios-Puga and Ammar Mandvi and Brian M. Khan and Martin Lilik and Jay Park and Benjamin L. Smarr},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2112.05782},
  year   = {2021}
}

备注

22 pages, 4 figures; submitted to PLOS ONE