小鼠脑组织区域辐射诱导转录组时间响应的多样性
神经元与认知
2024-04-30 v1 应用统计
摘要
多项研究表明，产前辐射暴露与晚期智力障碍之间存在潜在关联。这被认为源于妊娠期辐射暴露后中枢神经系统的长期发育变化与功能损伤。本研究对产前暴露于递增剂量X射线辐射的小鼠脑组织转录组谱进行了生物信息学分析。在胚胎期E11暴露于不同辐射剂量（0、0.1和1 Gy）的C57BL小鼠中，评估了不同脑区域（皮层、海马体、小脑）的基因表达水平，并在出生后不同时间点（出生后1个月和6个月）收集样本。本研究旨在阐明出生后不同时间间隔（1个月和6个月）不同脑区域对辐射响应的差异。使用二维统一流形逼近与投影（UMAP）对数据进行可视化，并采用方差分析（ANOVA）考察各因素的影响。观察到基因表达受各因素（组织、时间和剂量）影响，尽管程度不同。比较了各组织内不同剂量间的基因表达趋势，以及不同时间间隔下组织间的显著通路。此外，除了辐射响应通路外，Cytoscape的功能与网络分析揭示了与认知相关的各类通路的变化，这与已发表的数据[1] [2] [3]一致，表明产前暴露于辐射的动物存在晚期行为变化。
引用
@article{arxiv.2404.18660,
title = {Diversity in the radiation-induced transcriptomic temporal response of mouse brain tissue regions},
author = {Karolina Kulis and Sarah Baatout and Kevin Tabury and Joanna Polanska and Mohammed Abderrafi Benotmane},
journal= {arXiv preprint arXiv:2404.18660},
year = {2024}
}