F1-ATPase分子马达的离散态与连续态描述
亚细胞过程
2009-04-28 v1
摘要
我们开发了一个F1-ATPase分子马达的离散态模型，该模型不仅描述了旋转和ATP消耗速率对ATP、ADP和无机磷酸盐化学浓度的依赖性，还描述了对摩擦系数和外加扭矩等机械控制参数的依赖性。通过将其跃迁速率拟合到P. Gaspard和E. Gerritsma [J. Theor. Biol. 247 (2007) 672-686]的连续角度模型，该离散态模型获得了对这些机械参数的依赖性。该离散态模型描述了F1马达在机械运动与化学反应紧密耦合状态下的行为。通过这种方式，我们获得了F1马达的动力学和热力学性质，例如旋转和ATP消耗速率对ATP浓度的Michaelis-Menten依赖性及其在ADP和Pi存在下的扩展，它们对摩擦和外加扭矩的依赖性，以及化学和机械热力学效率。
引用
@article{arxiv.0904.4218,
title = {Discrete- versus continuous-state descriptions of the F1-ATPase molecular motor},
author = {E. Gerritsma and P. Gaspard},
journal= {arXiv preprint arXiv:0904.4218},
year = {2009}
}