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基于扩散模型的弥散磁共振成像高失真纤维取向分布恢复

图像与视频处理 2024-06-21 v1 计算机视觉与模式识别 医学物理

摘要

纤维取向分布(FOD)是表示弥散磁共振成像(dMRI)数据的流行模型。然而,dMRI中的成像伪影(如磁敏感性引起的失真)会导致信号丢失,并导致FOD的重建受损,从而阻碍受影响脑区(如脑干)的成功纤维追踪和连接性分析。生成模型,例如扩散模型,已成功应用于各种图像恢复任务。然而,它们在FOD图像上的应用提出了独特的挑战,因为FOD是四维数据,由球谐函数(SPHARM)表示,其第四维表现出与阶数相关的依赖性。在本文中,我们提出了一种新颖的用于FOD恢复的扩散模型,该模型可以恢复由失真伪影引起的信号丢失。我们使用体积-阶数编码来增强扩散模型生成所有SPHARM阶数下单个FOD体积的能力。此外,我们在生成每个单独的FOD体积时添加了从所有SPHARM阶数中提取的交叉注意力特征,以捕获FOD体积之间的阶数相关依赖性。我们还使用高失真区域周围的低失真FOD来条件化扩散模型,以保持生成FOD的几何一致性。我们使用来自英国生物银行(n = 1315)的数据训练和测试了我们的模型。在具有真实数据的测试集(n = 43)上,我们展示了所生成FOD在FOD体积均方根误差和FOD峰值角度误差方面的高精度。我们还将我们的方法应用于脑干区域存在大失真的测试集(n = 1172),并证明了我们的方法在恢复FOD完整性方面的有效性,从而大大改善了受影响脑区的纤维追踪性能。

关键词

引用

@article{arxiv.2406.13209,
  title  = {Diffusion Model-based FOD Restoration from High Distortion in dMRI},
  author = {Shuo Huang and Lujia Zhong and Yonggang Shi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2406.13209},
  year   = {2024}
}

备注

11 pages, 7 figures