跨多基因组检测基因创新以揭示表型多样性

基因创新是生命形式进化和表型多样性的关键机制。我们需要能够研究越来越多基因组序列中基因创新的工具，以最大化利用我们对生物系统的理解。本文介绍 Comparative-Phylostratigraphy，一个开源软件套件，能够确定新基因在进化时间上的出现时间，并同时跨多个物种的全基因组将基因出现模式与物种性状关联起来。这种比较策略是一种强大的新工具，可用于开始剖析基因创新与表型多样性之间的关系。我们通过分析最近发表的蚂蚁基因组来描述并展示我们的方法。这一新方法识别出蚂蚁类群中与生活史性状转变相关的显著新基因进化爆发。我们的方法允许随着新基因组数据的出现轻松整合，因此将成为对在基因层面解释生命多样性进化感兴趣的进化生物学家的一种有价值的分析工具。