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CryoFastAR:简易快速 Cryo-EM 原位重建

计算机视觉与模式识别 2025-10-15 v2

摘要

从无序图像进行姿态估计是 3D 重建、机器人和科学成像中基础性的任务。最近的几何基础模型,如 DUSt3R,使能端到端的稠密 3D 重建,但在科学成像领域如冷冻电子显微镜(cryo-EM)用于近原子蛋白质重建方面仍属未被充分探索的领域。在 cryo-EM 中,姿态估计和从无序粒子图像进行 3D 重建仍依赖于耗时的迭代优化,主要是由于低信噪比(SNR)和来自对比度传递函数(CTF)的失真。我们引入 CryoFastAR,这是第一个能直接从 Cryo-EM 噪声图像预测姿态以进行快速原位重建的几何基础模型。通过整合多视角特征并在大规模模拟 cryo-EM 数据(包括真实噪声和 CTF 调制)上进行训练,CryoFastAR 提升了姿态估计的准确性和泛化能力。为增强训练稳定性,我们提出了渐进式训练策略,即首先允许模型在较简单条件下提取基本特征,然后逐步增加难度以提高鲁棒性。实验表明,CryoFastAR 在合成和真实数据集上实现了相当的质量,同时显著加快了推断速度,超越传统迭代方法。

关键词

引用

@article{arxiv.2506.05864,
  title  = {CryoFastAR: Fast Cryo-EM Ab Initio Reconstruction Made Easy},
  author = {Jiakai Zhang and Shouchen Zhou and Haizhao Dai and Xinhang Liu and Peihao Wang and Zhiwen Fan and Yuan Pei and Jingyi Yu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2506.05864},
  year   = {2025}
}