蛋未孵先数鸡：用于估计分化时间的校准点的互反一致性
种群与进化
2010-01-21 v1
摘要
文献中一直关注使用二次校准时间点来估计进化分化时间的方法。这些时间点是根据一次外部校准时间点从一个分子数据集导出的分化时间估计，然后独立地用于第二个数据集。从逻辑上讲，一次和二次校准点必须相互一致，即必须能够从一个时间点预测另一个时间点。然而，Shaul和Graur (2002, Gene 300: 59-61) 评估二次时间点可靠性的尝试是有缺陷的，因为他们给出了时间估计而没有给出这些估计的置信区间，因此无法对分化时间进行任何明确的假设检验。此外，他们不恰当地排除了部分数据，导致对其中一个分化时间的估计存在严重偏差。在这里，我使用更合适的方法对同一数据集进行了重新分析，并得出结论认为不存在不一致性。然而，从分析中可以清楚地看出，分子数据通常具有如此大的置信区间，以至于它们没有信息量，因此不能用于可靠的假设检验。
引用
@article{arxiv.1001.3586,
title = {Counting chickens before they hatch: reciprocal consistency of calibration points for estimating divergence dates},
author = {David A. Morrison},
journal= {arXiv preprint arXiv:1001.3586},
year = {2010}
}
备注
8 pages, including 1 Table