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用于磁共振成像中基于神经网络颅骨剥离的上下文编码方法

图像与视频处理 2019-10-25 v1 机器学习 机器学习

摘要

颅骨剥离通常是磁共振图像中大多数脑分析流程的第一步。许多基于深度学习神经网络的方法已被开发以实现更高精度。由于 3D 深度学习模型计算成本高且受 GPU 内存限制挑战,已开发出多种 2D 深度学习方法。然而,现有 2D 深度学习方法难以有效捕获实现更高精度所需的 3D 语义信息。本文中,我们提出一种上下文编码方法,使 2D 网络能够捕获 3D 上下文信息。对于该上下文编码方法,首先我们对原始 2D 网络的 2D 特征进行编码,其次我们对 3D MRI 图像子卷进行编码,最后我们通过语义编码分类损失融合编码后的 2D 特征与 3D 特征。为获得计算效率,尽管我们对 3D MRI 图像子卷进行编码而非构建 3D 神经网络,在三个基准数据集上的大量实验表明,我们的方法能以 NFBS 上 99.6%、LPBA40 上 99.09% 和 OASIS 上 99.17% 的 dice 分数实现优于最先进替代方法的精度。

关键词

引用

@article{arxiv.1910.10798,
  title  = {Context-endcoding for neural network based skull stripping in magnetic resonance imaging},
  author = {Zhen Liu and Borui Xiao and Yuemeng Li and Yong Fan},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1910.10798},
  year   = {2019}
}

备注

draft for skull strip