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具有多体非马尔可夫记忆的粗粒化分子动力学构建

计算物理 2023-12-01 v1 化学物理 流体动力学

摘要

我们引入一种基于机器学习的粗粒化分子动力学(CGMD)模型,忠实保留分子间耗散相互作用的多体性质。与常见经验 CG 模型不同,本模型基于 Mori-Zwanzig 形式构建,自然继承了异构的态依赖记忆项,而非匹配速度自相关函数等平均场度量。数值结果表明,保留记忆项的多数体性质对于预测集体输运与扩散过程至关重要,而经验形式普遍表现出局限性。

关键词

引用

@article{arxiv.2304.09044,
  title  = {Construction of coarse-grained molecular dynamics with many-body non-Markovian memory},
  author = {Liyao Lyu and Huan Lei},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2304.09044},
  year   = {2023}
}