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多任务卷积神经网络(MT-CNN)与其他几种毒性预测方法的比较

定量方法 2017-04-03 v1 机器学习 机器学习

摘要

毒性分析与预测对人类健康和环境保护至关重要。现有的计算方法由种类繁多的描述符和回归器构建而成,这使得对其性能的分析变得困难。例如,深度神经网络(DNN)在许多场合都是一种成功的方法,但它如同黑盒,缺乏概念上的优雅或物理上的可解释性。本工作基于已建立的电荷、表面积和自由能物理模型,构建了一组通用的微观描述符,以在同等基础上评估多任务卷积神经网络(MT-CNN)架构及其他几种方法(包括随机森林(RF)和梯度提升决策树(GBDT))的性能。文中还对卷积神经网络(CNN)和非卷积深度神经网络(DNN)算法进行了比较。四个基准毒性数据集(即终点)被用于评估各种方法。大量的数值研究表明,本文的 MT-CNN 架构能够超越现有最先进的方法。

关键词

引用

@article{arxiv.1703.10951,
  title  = {Comparison of multi-task convolutional neural network (MT-CNN) and a few other methods for toxicity prediction},
  author = {Kedi Wu and Guo-Wei Wei},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1703.10951},
  year   = {2017}
}