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结合图神经网络与时空疾病模型预测德国 COVID-19 病例

机器学习 2021-01-05 v1 应用统计

摘要

2020 年期间,许多不同研究领域的学者研究了 COVID-19 的感染率。在此背景下,可靠且可解释的疾病发生预测是决策者管理医疗资源的重要工具。若干专家呼吁有必要考虑人类流动性以解释 COVID-19 的传播。现有方法常应用相应研究领域的标准模型。然而,这一习惯常伴随某些限制。例如,大多数统计或流行病学模型无法直接纳入非结构化数据源,包括可能编码人类流动性的关系数据。相反,机器学习方法可通过利用这些数据结构产生更好的预测,但缺乏直观可解释性,因为它们常被归类为黑箱模型。我们提出了两个研究方向之间的折衷,并给出了一种多模态学习方法,结合了统计回归与机器学习模型的优势,用于预测德国本地 COVID-19 病例。这种新方法能够使用更丰富的数据类型集合,包括流动流和共址概率,并在我们的基准研究中于整个观测期内取得了最低的 MSE 分数。结果证实了纳入流动性数据的必要性,并展示了我们方法的灵活性与可解释性。

关键词

引用

@article{arxiv.2101.00661,
  title  = {Combining Graph Neural Networks and Spatio-temporal Disease Models to Predict COVID-19 Cases in Germany},
  author = {Cornelius Fritz and Emilio Dorigatti and David Rügamer},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2101.00661},
  year   = {2021}
}