联合物种分布建模下物种相关性的澄清
统计方法学
2019-08-27 v1
摘要
联合物种分布建模近来受到越来越多的关注，它承认个体水平建模未能考虑物种间预期的相关性/相互作用。这些模型试图通过由一组潜在多元正态变量产生的相关矩阵来捕获物种相关性。然而，这些关联对于站点间物种相关行为的洞察甚少。我们关注使用纳入站点间空间相关性的联合物种建模的存在/缺失数据。对于物种对，我们强调诱导的优势比（连同共现联合概率）；它们对联合存在/缺失行为提供了更清晰的理解。事实上，我们提出了关注区域上的空间优势比曲面，以捕获相关性如何随区域变化。我们使用来自南非开普植物区的包含 600 多个物种、600 多个站点的数据集进行说明。我们展示了在联合物种分布模型下正相关与负相关物种对的优势比空间分布。与一组物种相关的多元正态协方差矩阵仅是创造物种间相关性的一种手段，但缺乏解释性。通过考虑优势比，定量生态学家将能更好地领会这些联合物种分布建模设定中隐含的物种间实际相关性。
引用
@article{arxiv.1908.09410,
title = {Clarifying species dependence under joint species distribution modeling},
author = {Alan E. Gelfand and Shinichiro Shirota},
journal= {arXiv preprint arXiv:1908.09410},
year = {2019}
}