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经典图神经网络是否是图级任务的简单基准?简单架构 meets 卓越

机器学习 2025-11-04 v3

摘要

消息传递图神经网络(GNNs)常因表达受限、过平滑、过压抑以及难以捕获长程依赖等问题受到批评。相比之下,图转换器(GTs)因采用全局注意力机制而被视为更优,可能缓解这些问题。文献常建议 GTs 在图级任务中优于 GNNs,尤其是在小分子图的图分类和回归任务中。本研究通过一个增强框架 GNN+(集成边缘特征、归一化、Dropout、残差连接、前馈网络和位置编码)探索 GNNs 在图级任务中的潜力。我们在 14 个著名图级数据集上系统性地重新评估了三个经典 GNN(GCN、GIN 和 GatedGCN)由 GNN+ 框架增强后的表现。我们的结果表明,与既定观念相反,这些经典 GNN 在所有数据集上一致匹配或超越 GTs 的性能,全部进入前三名,其中八个数据集获得第一名。此外,它们在许多数据集上运行速度快几个数量级。这凸显了简单 GNN 架构的潜力,挑战了 GTs 中复杂机制对获得卓越图级性能是必需的观念。我们的源代码已公开于 https://github.com/LUOyk1999/GNNPlus。

关键词

引用

@article{arxiv.2502.09263,
  title  = {Can Classic GNNs Be Strong Baselines for Graph-level Tasks? Simple Architectures Meet Excellence},
  author = {Yuankai Luo and Lei Shi and Xiao-Ming Wu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2502.09263},
  year   = {2025}
}

备注

ICML 2025