BrainLesion Suite：用于模块化脑病灶图像分析的灵活且用户友好框架
计算机视觉与模式识别
2025-07-15 v1 人工智能
机器学习
软件工程
摘要
BrainLesion Suite 是一个用于构建模块化脑病灶图像分析管道的 versatile 工具包，采用 Python 语言实现。遵循 Python 化原则，BrainLesion Suite 旨在提供“脑无感”开发体验，最小化认知负担， streamlining 创建复杂工作流程以用于临床和科学实践。在其核心是一个 adaptable 的预处理模块，执行 co-registration、atlas registration，以及可选的脑骨去除和去面部处理，用于任意多模态输入图像。BrainLesion Suite 利用来自 BraTS 挑战赛的算法，用于合成缺失模态、填补病灶并生成特定于病理的肿瘤分割。BrainLesion Suite 还支持对分割模型性能进行量化，提供诸如 panoptica 等工具以计算病灶相关指标。虽然 BrainLesion Suite 最初是为脑病灶图像分析管道开发的，例如脑肿瘤、转移瘤和多发性硬化，但可以适用于其他医学图像分析应用。BrainLesion Suite 的各个软件包和教程均可在 GitHub 上访问。
引用
@article{arxiv.2507.09036,
title = {BrainLesion Suite: A Flexible and User-Friendly Framework for Modular Brain Lesion Image Analysis},
author = {Florian Kofler and Marcel Rosier and Mehdi Astaraki and Hendrik Möller and Ilhem Isra Mekki and Josef A. Buchner and Anton Schmick and Arianna Pfiffer and Eva Oswald and Lucas Zimmer and Ezequiel de la Rosa and Sarthak Pati and Julian Canisius and Arianna Piffer and Ujjwal Baid and Mahyar Valizadeh and Akis Linardos and Jan C. Peeken and Surprosanna Shit and Felix Steinbauer and Daniel Rueckert and Rolf Heckemann and Spyridon Bakas and Jan Kirschke and Constantin von See and Ivan Ezhov and Marie Piraud and Benedikt Wiestler and Bjoern Menze},
journal= {arXiv preprint arXiv:2507.09036},
year = {2025}
}
备注
16p, 3f