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BioAug:基于条件生成的低资源生物医学NER数据增强

计算与语言 2023-05-19 v1 人工智能 信息检索

摘要

生物医学命名实体识别(BioNER)是从生物医学文本中识别命名实体的基础任务。然而,由于标注所需的高度专业和专家知识,BioNER遭受严重的数据稀缺并缺乏高质量标注数据。尽管数据增强已被证明对一般低资源NER非常有效,现有数据增强技术无法为BioNER生成事实性和多样性兼备的增强数据。本文提出BioAug,一种面向低资源BioNER的新颖数据增强框架。BioAug基于BART构建,训练以解决基于选择性掩码和知识增强的新颖文本重建任务。训练后,我们执行条件生成,并以类似于训练阶段的选择性损坏文本为条件生成多样化增强数据。我们在5个基准BioNER数据集上展示了BioAug的有效性,表明BioAug以显著优势(1.5%-21.5%绝对提升)优于所有基线,并能生成更具事实性和多样性的增强数据。代码:https://github.com/Sreyan88/BioAug。

关键词

引用

@article{arxiv.2305.10647,
  title  = {BioAug: Conditional Generation based Data Augmentation for Low-Resource Biomedical NER},
  author = {Sreyan Ghosh and Utkarsh Tyagi and Sonal Kumar and Dinesh Manocha},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2305.10647},
  year   = {2023}
}

备注

SIGIR 2023