BERN2：一种先进的神经生物医学命名实体识别与归一化工具
计算与语言
2022-10-07 v3
摘要
在生物医学自然语言处理中，命名实体识别（NER）与命名实体归一化（NEN）是能够从不断增长的生物医学文献中自动抽取生物医学实体（如疾病和药物）的关键任务。在本文中，我们提出BERN2（Advanced Biomedical Entity Recognition and Normalization），一种通过采用多任务NER模型与基于神经网络的NEN模型来实现更快更准确推断、从而改进先前基于神经网络的NER工具的工具。我们希望我们的工具能帮助为生物医学知识图谱构建等多种任务标注大规模生物医学文本。
引用
@article{arxiv.2201.02080,
title = {BERN2: an advanced neural biomedical named entity recognition and normalization tool},
author = {Mujeen Sung and Minbyul Jeong and Yonghwa Choi and Donghyeon Kim and Jinhyuk Lee and Jaewoo Kang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2201.02080},
year = {2022}
}
备注
Published in Bioinformatics 2022. Web service available at http://bern2.korea.ac.kr. Code available at https://github.com/dmis-lab/BERN2