进化论的贝叶斯支持：在灵长类家族子集上检测系统发育信号
定量方法
2018-08-09 v1 种群与进化
摘要
进化论指出，物种多样性可以通过带有修饰的传代来解释。因此，所有生物都通过共同祖先相关联。这一进化过程必然在我们的分子组成中留下了痕迹。本工作中，我们提出一种随机化过程，以确定灵长类家族的一组5个物种，即猕猴、黑白疣猴、猩猩、黑猩猩和人类，是否在其分子中保留了这些痕迹。首先，我们通过两个玩具示例展示随机化方法学，以理解其逻辑。然后我们进行DNA数据分析，评估该灵长类群体是否包含将它们联系在共同进化历史中的系统发育信息。这是通过监测一个称为边际似然（marginal likelihood）的贝叶斯度量来实现的，我们使用嵌套采样对其进行了估计。我们发现，如果它们没有共享共同祖先，那么在这些灵长类物种的数据中观察到的关系将是不寻常的。结果与进化论完全一致。
引用
@article{arxiv.1709.04588,
title = {Bayesian support for Evolution: detecting phylogenetic signal in a subset of the primate family},
author = {Patricio Maturana Russel},
journal= {arXiv preprint arXiv:1709.04588},
year = {2018}
}