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使用 R 包 slgf 进行具有潜在基于组效应与方差的贝叶斯模型选择

统计方法学 2024-04-11 v1

摘要

线性建模无处不在,但当模型设定错误时,其性能可能会受到影响。我们最近证明了,分类预测变量水平中的潜在分组会复杂化包括生物信息学、农业、工业、工程和医学在内的多个领域的推断。在此,我们介绍了 R 包 slgf,它使用户能够轻松实现我们最近开发的方法,通过贝叶斯模型选择来检测基于组的回归效应、潜在交互作用和/或异方差误差方差。我们重点关注分类预测变量的水平表现出两个潜在分组的场景。我们将这种分组结构的检测视为一个无监督学习问题,通过搜索因子水平的可能分组空间来实现。我们首先回顾了疑似潜在分组因子(SLGF)方法。接下来,使用观测数据和实验数据,我们阐明了 slgf 在几种常见线性模型布局中的用法:单因素方差分析(ANOVA)、协方差分析(ANCOVA)、双因素重复布局以及双因素无重复布局。我们选择的数据揭示了经典分析的缺陷,以强调当存在潜在分组结构时我们的方法所能提供的优势。

关键词

引用

@article{arxiv.2404.06698,
  title  = {Bayesian Model Selection with Latent Group-Based Effects and Variances with the R Package slgf},
  author = {Thomas A. Metzger and Christopher T. Franck},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2404.06698},
  year   = {2024}
}

备注

17 pages, 5 figures