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配体生化活性预测相关性的平衡

机器学习 2021-04-07 v1

摘要

本文提出一种用于平衡预测相关性模型的技术,该模型涉及针对生物靶标的配体生化活性的监督建模。我们采用常规监督机器学习技术即支持向量机训练未校准模型。遗憾的是,SVM存在严重缺陷:它们对不平衡数据集、离群值及训练样本间的高多重共线性敏感,这可能导致偏袒某一组而非另一组。因此,可能需要额外的校准以平衡模型的预测相关性。作为此种平衡技术,我们提出Platt缩放。所得结果在从ExCAPE数据库导出的数据集上训练的单靶标模型上予以展示。不同于传统使用的机器技术,我们侧重于采用确定性求解器来降低不确定性。

关键词

引用

@article{arxiv.2104.02307,
  title  = {Balancing Predictive Relevance of Ligand Biochemical Activities},
  author = {Marek Pecha},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2104.02307},
  year   = {2021}
}