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结合 CNN 与 CPPN 的 3D 超声数据中新生儿脑室自动分割与位置学习

图像与视频处理 2021-02-23 v2 计算机视觉与模式识别

摘要

早产儿极有可能罹患脑室扩大(ventriculomegaly),即脑室系统(CVS)扩张。该病症可发展为危及生命的脑积水,并与日后神经发育障碍相关,因此必须由医师检测与监测。在临床常规中,对 2D 超声(US)图像进行手动 2D 测量以估算 CVS 体积,但因缺乏 3D 信息此法不精确。解决该问题的一种途径是开发面向 3D US 数据的自动 CVS 分割算法。本文探究 2D 与 3D 卷积神经网络(CNN)解决此复杂任务的潜力,并提议使用组合模式生成网络(CPPN)使 CNN 能够学习 CVS 位置。我们的数据库由 21 名胎龄 35.8±1.635.8 \pm 1.6 周的早产儿采集的 25 个 3D US 体积组成。我们发现 CPPN 能够编码 CVS 位置,在 CNN 层数较少时提升其精度。在脑室扩张情形下,2D 与 3D CNN 的精度达到观察者内变异(IOV),Dice 分别为 0.893±0.0080.893 \pm 0.0080.886±0.0040.886 \pm 0.004(IOV = 0.898±0.0080.898 \pm 0.008),体积误差分别为 0.45±0.420.45 \pm 0.42 cm3^30.36±0.240.36 \pm 0.24 cm3^3(IOV = 0.41±0.050.41 \pm 0.05 cm3^3)。在正常脑室情形下,3D CNN 优于 2D CNN,Dice 为 0.797±0.0410.797 \pm 0.0410.776±0.0380.776 \pm 0.038(IOV = 0.816±0.0090.816 \pm 0.009),体积误差为 0.35±0.290.35 \pm 0.29 cm3^30.35±0.240.35 \pm 0.24 cm3^3(IOV = 0.2±0.110.2 \pm 0.11 cm3^3)。尺寸为 320×320×320320 \times 320 \times 320 的体积的最佳分割时间由 2D CNN 取得,为 3.5±0.23.5 \pm 0.2 s。

关键词

引用

@article{arxiv.2012.03014,
  title  = {Automatic Segmentation and Location Learning of Neonatal Cerebral Ventricles in 3D Ultrasound Data Combining CNN and CPPN},
  author = {Matthieu Martin and Bruno Sciolla and Michaël Sdika and Philippe Quétin and Philippe Delachartre},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2012.03014},
  year   = {2021}
}

备注

18 pages, 14 figures