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基于U-net和Transformer分割的7特斯拉MRI多发性硬化症病变自动检测

计算机视觉与模式识别 2026-04-02 v1 机器学习

摘要

超高场7特斯拉(7T)MRI改善了多发性硬化症(MS)白质病变(WML)的可视化,但其对比度和伪影与1.5-3T成像存在足够差异——表明广泛使用的自动分割工具可能无法直接迁移。我们分析了7T FLAIR扫描,并从病变分割工具(LST)输出生成参考WML掩膜,随后由专家进行人工修订。作为外部比较器,我们应用了最初在低场数据上开发的LST-LPA和较新的LST-AI集成方法。随后,我们在多个分辨率(0.5×0.5×0.5³、1.0×1.0×1.0³和1.5×1.5×2.0³)下使用7T FLAIR训练了3D UNETR和SegFormer Transformer模型,并使用BraTS 2023框架的体素级和病变级指标评估了所有方法。在原生0.5×0.5×0.5³分辨率的保留测试集上,7T训练的Transformer模型与LST-AI达到了具有竞争力的重叠,同时恢复了经典方法遗漏的额外小病变,代价是一些边界变异性和偶发的伪影相关假阳性。在保留的7T测试集上,我们最佳的Transformer模型(SegFormer)达到了体素级Dice为0.61和病变级Dice为0.20,优于经典LST-LPA工具(Dice 0.39,病变级Dice 0.02)。在降采样图像上训练的模型性能下降,强调了原生7T分辨率对小病变检测的价值。通过发布我们的7T训练模型,我们旨在为超高场MS研究中的自动病变量化提供一个可复现、即用即用的资源(https://github.com/maynord/7T-MS-lesion-segmentation)。

关键词

引用

@article{arxiv.2604.00469,
  title  = {Automated Detection of Multiple Sclerosis Lesions on 7-tesla MRI Using U-net and Transformer-based Segmentation},
  author = {Michael Maynord and Minghui Liu and Cornelia Fermüller and Seongjin Choi and Yuxin Zeng and Shishir Dahal and Daniel M. Harrison},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2604.00469},
  year   = {2026}
}

备注

31 pages, 3 figures, 3 tables. Inference code and model weights available at https://github.com/maynord/7T-MS-lesion-segmentation