单细胞深度学习在阐明腹部与体表炎症图谱关系中的应用
基因组学
2025-03-25 v1
摘要
作为整合体内稳态的系统，生命体系受到腹部炎症的影响，可能扰乱内部环境的平衡。关于体表 spreads 皮下结缔组织（scFascia）在此过程中的作用，了解仍不充分。在 Salmonella 诱导的腹泻大鼠模型中，scRNA-seq 结合深度学习分析揭示了巨噬细胞（MPs）出现 Warburg 样代谢重编程，糖酵解活性下降。Cd34+/Pdgfra+ telocytes（CPTCs）通过 Wnt/Fgf 信号调控 MPs 的分化与增殖，提示 scFascia 中存在病理性相互作用模式，称为腹部-体表炎症相互作用图谱（FVICP）。PySCENIC 分析显示，转录因子 Fosl1、Nfkb2、Atf4 活性增加，这些转录因子受 CPTCs 信号调控，下调了有氧呼吸，上调了细胞周期、DNA 复制和转录过程。该研究凸显了 scFascia 在腹部炎症期间的免疫调节和代谢重编程中的作用，强化了其在系统性稳态中的功能。
引用
@article{arxiv.2503.17418,
title = {Application of Single-cell Deep Learning in Elucidating the Mapping Relationship Between Visceral and Body Surface Inflammatory Patterns},
author = {Haixiang Huang and Bingbing Shen and Zhenwei Zhang and Jianming Yue and Lu Mei and Qiusheng Chen},
journal= {arXiv preprint arXiv:2503.17418},
year = {2025}
}
备注
25pages, 7 figures, under review