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基于报告引导病灶标注的标注高效癌症检测:用于 bpMRI 中基于深度学习的前列腺癌检测

图像与视频处理 2024-07-01 v2 计算机视觉与模式识别

摘要

基于深度学习的诊断性能随标注数据增多而提升,但大规模人工标注昂贵且费力。专家在临床常规中评估诊断图像,并将发现写入报告。利用未标注检查与临床报告配对可克服人工标注瓶颈。我们假设,检测模型可通过使用模型预测生成的自动标注进行半监督训练,并由临床报告中的稀疏信息引导。为证明有效性,我们训练临床显著性前列腺癌(csPCa)分割模型,其中自动标注由放射学报告中临床显著性发现的数量引导。我们纳入了 7,756 例前列腺 MRI 检查,其中 3,050 例为人工标注。我们在来自外部中心、具有组织病理学确认金标准的 300 例检查上评估前列腺癌检测性能。半监督训练将基于患者的诊断受试者工作特征曲线下面积从 87.2±0.8%87.2 \pm 0.8\% 提升至 89.4±1.0%89.4 \pm 1.0\%P<104P<10^{-4}),并将每例一个假阳性下的基于病灶的灵敏度从 76.4±3.8%76.4 \pm 3.8\% 提升至 83.6±2.3%83.6 \pm 2.3\%P<104P<10^{-4})。半监督训练在病例级性能上标注效率提高 14×\times,在病灶级性能上标注效率提高 6×\times。这一性能提升证明了我们训练流程的可行性。源代码公开于 github.com/DIAGNijmegen/Report-Guided-Annotation。最佳 csPCa 检测算法可在 grand-challenge.org/algorithms/bpmri-cspca-detection-report-guided-annotations/ 获取。

关键词

引用

@article{arxiv.2112.05151,
  title  = {Annotation-efficient cancer detection with report-guided lesion annotation for deep learning-based prostate cancer detection in bpMRI},
  author = {Joeran S. Bosma and Anindo Saha and Matin Hosseinzadeh and Ilse Slootweg and Maarten de Rooij and Henkjan Huisman},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2112.05151},
  year   = {2024}
}