基于SynthMorph的解剖感知且与采集无关联合配准
图像与视频处理
2024-07-15 v4 人工智能
计算机视觉与模式识别
机器学习
摘要
仿射图像配准是医学图像分析的基石。虽然经典算法可以达到极好的精度,但它们对每一对图像都需进行耗时的优化。深度学习方法(DL)学习一个将图像对映射到输出变换的函数。函数求值很快,但捕捉大幅变换可能具有挑战性,且若测试图像特征偏离训练域(如分辨率),网络往往表现不佳。大多数仿射方法对用户希望对齐的解剖结构不敏感,这意味着若算法考虑图像中的所有结构,配准将不准确。我们通过SynthMorph解决这些不足,这是一个快速、对称、微分同胚且易用的DL工具,用于任意脑图像的仿射-可变形联合配准而无需预处理。首先,我们采用一种策略,用从标签图合成的差异极大的图像训练网络,从而对训练时未见的图像类型产生鲁棒性能。其次,我们优化所选解剖标签的空间重叠。这使网络能区分感兴趣解剖结构与无关结构,消除了排除可能妨碍解剖特异性配准内容的预处理需求。第三,我们将仿射模型与可变形超网络结合,让用户在配准时以其特定数据的最优变形场正则性进行选择,耗时仅为经典方法的一小部分。我们分析了竞争架构如何学习仿射变换,并在极多样的神经影像数据上比较了最先进的配准工具,旨在真正捕捉现实世界中方法的行为。SynthMorph展现出高精度,并可于 https://w3id.org/synthmorph 获取,作为脑MRI配准的单一完整端到端解决方案。
引用
@article{arxiv.2301.11329,
title = {Anatomy-aware and acquisition-agnostic joint registration with SynthMorph},
author = {Malte Hoffmann and Andrew Hoopes and Douglas N. Greve and Bruce Fischl and Adrian V. Dalca},
journal= {arXiv preprint arXiv:2301.11329},
year = {2024}
}
备注
33 pages, 19 figures, 4 tables, affine registration, deformable registration, deep learning, hypernetwork, domain shift, neuroimaging, final published version