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随机闪烁棘轮中布朗马达效应的解析方面

经典分析与常微分方程 2013-05-09 v2 偏微分方程分析 动力系统 泛函分析

摘要

肌肉收缩、ATP合酶的运作、细胞形状的维持被认为是由马达蛋白保障的,这些蛋白可以用布朗棘轮机制建模。我们考虑布朗马达的随机闪烁棘轮模型,其中粒子可以处于两种状态,只有一种状态对施加的空间周期势敏感(数学设定是一对弱耦合的反应扩散方程和福克-普朗克方程)。我们证明该机制确实产生单向输运,通过显示势阱中的质量从左到右减少/增加。输运方向唯一地由势的每个最小值相对于其相邻最大值的所谓扩散均值的位置决定。输运不仅可由非对称势产生,也可由对称势和非对称跃迁率产生,作为一般结果的结果,我们推导了后者发生的显式条件。当跃迁局限于蛋白质构象空间中的狭窄活性位点时,我们得到了体输运方向的更显式表征,并推断出马达效应的一些常见前提是冗余的。

关键词

引用

@article{arxiv.1302.0253,
  title  = {Analytical aspects of the Brownian motor effect in randomly flashing ratchets},
  author = {Dmitry Vorotnikov},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1302.0253},
  year   = {2013}
}

备注

30 pages, to appear in J Math Biol