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一种计算捕光系统中激发能传递的高效方法:应用于 FMO 复合体

量子物理 2012-02-07 v1 生物物理

摘要

利用从非马尔可夫量子态扩散(NMQSD)导出的主方程,计算了光合 Fenna-Matthews-Olson(FMO)色素-蛋白复合体在不同温度下的激发能传递。该方法使我们能够处理显式包含与发色团内部振动模式耦合的谱密度。此外,该方法非常高效,传递动力学可在标准 PC 上约一分钟内计算完成,使得针对参数变化的系统研究变得可行。在证明我们的方法能够重现数值精确的层级运动方程(HEOM)方法的结果后,我们展示了振动模式的引入如何影响传递。

关键词

引用

@article{arxiv.1106.5259,
  title  = {An efficient method to calculate excitation energy transfer in light harvesting systems. Application to the FMO complex},
  author = {G. Ritschel and J. Roden and W. T. Strunz and A. Eisfeld},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1106.5259},
  year   = {2012}
}