结合文本信息抽取、分面搜索与信息可视化的开源工具架构
人机交互
2018-10-31 v1 信息检索
摘要
本文介绍了我们将复杂且部分非结构化的医疗数据整合到临床研究数据库中并随之提供决策支持的步骤。我们的主要应用是一个集成的分面搜索工具，辅以从文本文档中自动信息抽取结果的可视化。我们描述了技术架构（开源工具）的细节，以便在其他大学、研究机构或医院复现。我们的示例用例为肾脏病学与乳腺摄影。该软件最初在肾脏病学领域开发，随后适配至乳腺摄影用例。我们报告了这些案例研究，说明了临床医生如何使用该应用以及可以回答哪些问题。我们展示了我们的架构及所采用的软件模块仅需少量适配便适用于这两个应用领域。例如，在肾脏病学中，我们试图回答关于事件序列时间特征的问题，以从数据中获取用于队列选择的显著洞察。我们提出了一种多功能时间线工具，使用户能够探索多种诊断与实验室值之间的关系。
引用
@article{arxiv.1810.12627,
title = {An architecture of open-source tools to combine textual information extraction, faceted search and information visualisation},
author = {Daniel Sonntag and Hans-Jürgen Profitlich},
journal= {arXiv preprint arXiv:1810.12627},
year = {2018}
}
备注
Preprint submitted to Artificial Intelligence in Medicine