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基于加速深度卷积神经网络的精确肿瘤组织区域检测

计算机视觉与模式识别 2020-04-21 v1

摘要

用于癌症诊断的病理切片人工标注工作繁琐且重复性高。因此,大量努力致力于开发计算机视觉解决方案。我们的方法(FLASH)基于深度卷积神经网络(DCNN)架构。它降低了计算成本,并且比典型的深度学习方法快两个数量级,使得高通量处理成为可能。在使用深度学习方法的计算机视觉方法中,输入图像被细分为多个图像块,这些图像块分别通过神经网络。从这些块中提取的特征被分类器用于标注相应区域。我们的方法在将所有提取的特征传递给分类器之前,将其聚合到一个单一的矩阵中。此前,特征是从重叠的块中提取的。聚合特征消除了处理重叠块的需要,从而减少了所需的计算量。DCNN 和 FLASH 展示了高灵敏度(约 0.96)、良好的精确度(约 0.78)和高 F1 分数(约 0.84)。FLASH 和 DCNN 处理每个样本的平均时间分别为 96.6 秒和 9489.20 秒。我们的方法比原始 DCNN 方法快约 100 倍,同时保持了高准确度和精确度。

关键词

引用

@article{arxiv.2004.08552,
  title  = {Accurate Tumor Tissue Region Detection with Accelerated Deep Convolutional Neural Networks},
  author = {Gabriel Tjio and Xulei Yang and Jia Mei Hong and Sum Thai Wong and Vanessa Ding and Andre Choo and Yi Su},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2004.08552},
  year   = {2020}
}

备注

9 pages, 6 figures, 3 tables