基于量子纠缠增强的统一细胞内 pH 图景:SITE-pHorin 探针
定量方法
2024-07-08 v1 生物物理
生物大分子
亚细胞过程
摘要
准确绘制细胞内细胞器 pH 图谱对于理解细胞代谢和细胞器功能至关重要。然而,尚缺乏使用单一探针绘制统一细胞内 pH 光谱的工作。本文开发了一种新型量子纠缠增强型 pH 敏感探针SITE-pHorin,具备宽广的 pH 敏感范围和比值定量测量能力。随后,我们测量了 various 细胞器及其亚细胞部位的 pH 值,包括线粒体亚空间、糖体堆积体、内质网、溶酶体、过氧体和内体,在 COS-7 细胞中进行测量。针对线粒体细胞器 pH 的长期争议,我们测量了线粒体叶片的 pH 为 6.60 ± 0.40,线粒体髓质间空间的 pH 为 6.95 ± 0.30,以及两种线粒体基质 pH 分别约为 7.20 ± 0.27 和 7.50 ± 0.16。值得注意的是,溶酶体 pH 显示出以 4.79 ± 0.17 为中心的单一狭小高斯分布。此外,量子化学计算揭示了,Y182 残基去质子化以及色素环的离散曲率变形都对 SITE-pHorin 的量子纠缠机制至关重要。令人惊讶的是,我们的发现表明,线粒体叶片与基质之间存在准确的 pH 梯度(0.6-0.9 pH 单位),暗示关于 ΔpH(0.4-0.6)和线粒体质子动力力(pmf)的先行认知可能被低估了。
引用
@article{arxiv.2407.04232,
title = {A Unified Intracellular pH Landscape with SITE-pHorin: a Quantum-Entanglement-Enhanced pH Probe},
author = {Shu-Ang Li and Xiao-Yan Meng and Su Zhang and Ying-Jie Zhang and Run-Zhou Yang and Dian-Dian Wang and Yang Yang and Pei-Pei Liu and Jian-Sheng Kang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2407.04232},
year = {2024}
}
备注
64 pages, 7 figures, the supplemental material contains 13 supplemental figures and 4 supplemental tables