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用于优化活体 $^{31}$P 磁共振成像重建与后处理流水线的工具箱

医学物理 2024-10-08 v2

摘要

背景:X 核成像(如 31P MRI)由于磁旋比和组织浓度低于 1H MRI,存在信噪比(SNR)低的问题。提高 SNR 需要高场强、高级线圈、优化序列和复杂的重建方法。优化的流水线对于最大化 X 核成像的 SNR 至关重要。目的:开发一个用于快速 31P MR 成像的重建与处理方法工具箱,并评估两种数据类型的最佳流水线:31P-GRE 和类 bSSFP 的 MRF 成像。方法:该工具箱包括线圈合并(自适应和 whitened-SVD)、k 空间滤波、重建(带 FFT 和 NUFFT 的 Kaiser-Bessel 重网格化)以及去噪(压缩感知和 MP-PCA)。31P MR 数据集是在 7T 下使用螺旋编码、双调鸟笼线圈和 32 通道相控阵采集的。GRE 参数:读出 18.62ms,翻转角 59deg,TR 5400ms,TE 0.3ms。MRF 使用类 bSSFP 方案:读出 9.12ms,TR 19.8ms,TE 0.3ms。结果:对于 GRE 数据,自适应线圈合并结合 Kaiser-Bessel 重网格化(AC-KB)实现了最高的平均 SNR:38(体模)和 3.4(活体),优于其他方法。对于 MRF 数据,whitened-SVD 结合 Kaiser-Bessel 重网格化产生了 18 的 SNR,超过了 AC-KB 的 16。MP-PCA 对 GRE 数据去噪有效;压缩感知适合 MRF 数据。结论:我们展示了一个用于优化快速 31P MR 成像流水线的工具箱。最佳方法取决于采集方式和数据。Kaiser-Bessel 重网格化优于 NUFFT。自适应线圈合并和 MP-PCA 去噪适用于 GRE 数据;whitened-SVD 和压缩感知在 MRF 数据中表现更优。仔细选择处理方法至关重要,因为传统的 1H MRI 技术可能不够。该工具箱促进了对其他 X 核数据集的未来研究。

关键词

引用

@article{arxiv.2409.16221,
  title  = {A Toolbox for Optimization of Reconstruction and Post-processing Pipelines in In Vivo $^{31}$P MR Imaging},
  author = {Pontus Pandurevic and Mark Stephan Widmaier and Zhiwei Huang and Lijing Xin},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2409.16221},
  year   = {2024}
}

备注

20 pages, 9 figures