动质体线粒体基因重排优势的数学模型
种群与进化
2013-07-05 v1
摘要
我们对动质体中线粒体基因表达的复杂方式——全编辑（pan-editing）及其优势进行了建模和讨论。全编辑的快速传播和保留似乎归因于其伴随的片段分散。这种分散通过将非表达片段与仍需要的部分连接起来，防止了在激烈的种内竞争期间暂时非表达的线粒体基因丢失。我们通过数学建模研究了由于缺乏选择压力，这种片段关联对基因丢失的保护作用。这给出了诸如重排程度、种群大小以及在有限选择下仍保留完整基因组的世代数等参数的取值范围。获得的数值似乎与观测值一致。我们发现分散程度与种群丢失基因所需的世代数之间存在准线性相关性，表明全编辑可以被选择以在松弛的选择压力下有效限制基因丢失。
引用
@article{arxiv.1307.1163,
title = {A mathematical model of kinetoplastid mitochondrial gene scrambling advantage},
author = {Harry Buhrman and Peter van der Gulik and Simone Severini and David Speijer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1307.1163},
year = {2013}
}
备注
22 pages, 2 figures