复杂动态几何网络状态与功能拓扑的模拟与估计框架
无序系统与神经网络
2010-06-23 v3 数学物理
math.MP
生物物理
神经元与认知
摘要
我们提出一个框架，用于模拟几何网络（即可映射到某空间中的几何图的网络）中的信号传播，并开发用于估计（即映射）复杂动态几何网络状态与功能拓扑的算法。在该框架内，我们定义了此类网络中通常存在且与生物细胞神经网络特别相关的关键特征：动力学、信号传导、观测和控制。该框架特别适用于根据实验可观测数据估计细胞神经网络中的功能连接性，并已利用图形处理单元（GPU）高性能计算实现。在计算上，该框架能够以接近或快于实时的方式模拟细胞网络信号传导。我们进一步提出了一套标准网络测试集，用于衡量性能并比较不同的映射算法。
引用
@article{arxiv.0908.3934,
title = {A framework for simulating and estimating the state and functional topology of complex dynamic geometric networks},
author = {Marius Buibas and Gabriel A. Silva},
journal= {arXiv preprint arXiv:0908.3934},
year = {2010}
}
备注
Revised following initial peer review. Current version 28 pages and 7 figures. A slightly modified version has been accepted to Neural Computation and is now in press