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用于肝脏及肿瘤自动分割的二维密集连接卷积神经网络

计算机视觉与模式识别 2018-02-08 v1

摘要

本文提出一种全自动的两阶段级联方法,利用密集连接全卷积神经网络(DenseNet)在CT(计算机断层扫描)图像中分割肝脏及其肿瘤。我们独立训练肝脏和肿瘤分割模型,并将它们级联以实现肝脏及其肿瘤的组合分割。第一阶段涉及肝脏分割,第二阶段利用第一阶段的分割结果定位肝脏,进而在肝脏区域内进行肿瘤分割。肝脏模型在降采样的轴向切片(256×256)(256 \times 256)上训练,而肿瘤模型未对切片进行降采样,而是在三个不同亨氏(HU)水平的窗宽窗位CT轴向切片上训练。在测试集上,我们的模型在肝脏和肿瘤上分别取得了0.923和0.625的全局Dice系数,计算得到的肿瘤负荷的rmse为0.044。

关键词

引用

@article{arxiv.1802.02182,
  title  = {2D-Densely Connected Convolution Neural Networks for automatic Liver and Tumor Segmentation},
  author = {Krishna Chaitanya Kaluva and Mahendra Khened and Avinash Kori and Ganapathy Krishnamurthi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1802.02182},
  year   = {2018}
}