Related papers
Related papers: GPU-accelerated Red Blood Cells Simulations with T…
200 papers
We introduce a GPU-accelerated simulation tool, named Modeling on Shallow Flows with Efficient Simulation for Two-Phase Debris Flows (MoSES_2PDF), of which the input and output data can be linked to the GIS system for engineering…
Computational Engineering, Finance, and Science · Computer Science
2021-04-15
Chi-Jyun Ko , Po-Chih Chen , Hock-Kiet Wong , Yih-Chin Tai
Many-body perturbation theory is a powerful method to simulate electronic excitations in molecules and materials starting from the output of density functional theory calculations. By implementing the theory efficiently so as to run at…
Temporal Interaction Graphs (TIGs) are widely employed to model intricate real-world systems such as financial systems and social networks. To capture the dynamism and interdependencies of nodes, existing TIG embedding models need to…
Machine Learning · Computer Science
2023-09-12
Xi Chen , Yongxiang Liao , Yun Xiong , Yao Zhang , Siwei Zhang , Jiawei Zhang , Yiheng Sun
Besides their huge technological importance, fluidized beds have attracted a large amount of research because they are perfect playgrounds to investigate highly dynamic particulate flows. Their over-all behavior is determined by…
Extensions to the C++ implementation of the QCD Data Parallel Interface are provided enabling acceleration of expression evaluation on NVIDIA GPUs. Single expressions are off-loaded to the device memory and execution domain leveraging the…
The Cellular Potts Model (CPM) is a widely used simulation paradigm for systems of interacting cells that has been used to study scenarios ranging from plant development to morphogenesis, tumour growth and cell migration. Despite their wide…
Tissues and Organs · Quantitative Biology
2023-12-18
Shabaz Sultan , Sapna Devi , Scott N. Mueller , Johannes Textor
We developed a high-speed image reduction pipeline using Graphics Processing Units (GPUs) as hardware accelerators. Astronomers desire detecting EM counterpart of gravitational-wave sources as soon as possible for sharing positional…
Instrumentation and Methods for Astrophysics · Physics
2020-10-14
Masafumi Niwano , Katsuhiro L. Murata , Ryo Adachi , Sili Wang , Yutaro Tachibana , Youichi Yatsu , Nobuyuki Kawai , Takashi Shimokawabe , Ryousuke Itoh
Large-scale observational health databases are increasingly popular for conducting comparative effectiveness and safety studies of medical products. However, increasing number of patients poses computational challenges when fitting survival…
Computation · Statistics
2023-10-26
Jianxiao Yang , Martijn J. Schuemie , Xiang Ji , Marc A. Suchard
Data compression is a critical technology for large-scale plasma simulations. Storing complete particle information requires Terabyte-scale data storage, and analysis requires ad-hoc scalable post-processing tools. We propose a…
Computational Engineering, Finance, and Science · Computer Science
2025-04-24
Andong Hu , Luca Pennati , Ivy Peng , Stefano Markidis
Molecular Dynamics (MD) simulation is a powerful tool for understanding the dynamics and structure of matter. Since the resolution of MD is atomic-scale, achieving long time-scale simulations with femtosecond integration is very expensive.…
Machine Learning · Computer Science
2022-04-27
Zijie Li , Kazem Meidani , Prakarsh Yadav , Amir Barati Farimani
The rapid development of general-purpose computing on graphics processing units (GPGPU) is allowing the implementation of highly-parallelized Monte Carlo simulation chains for particle physics experiments. This technique is particularly…
Computational Physics · Physics
2025-06-06
DUNE Collaboration , A. Abed Abud , B. Abi , R. Acciarri , M. A. Acero , M. R. Adames , G. Adamov , M. Adamowski , D. Adams , M. Adinolfi , C. Adriano , A. Aduszkiewicz , J. Aguilar , Z. Ahmad , J. Ahmed , B. Aimard , F. Akbar , K. Allison , S. Alonso Monsalve , M. Alrashed , C. Alt , A. Alton , R. Alvarez , P. Amedo , J. Anderson , D. A. Andrade , C. Andreopoulos , M. Andreotti , M. P. Andrews , F. Andrianala , S. Andringa , N. Anfimov , W. L. Anicézio Campanelli , A. Ankowski , M. Antoniassi , M. Antonova , A. Antoshkin , S. Antusch , A. Aranda-Fernandez , L. Arellano , L. O. Arnold , M. A. Arroyave , J. Asaadi , A. Ashkenazi , L. Asquith , A. Aurisano , V. Aushev , D. Autiero , M. Ayala-Torres , F. Azfar , A. Back , H. Back , J. J. Back , I. Bagaturia , L. Bagby , N. Balashov , S. Balasubramanian , P. Baldi , W. Baldini , B. Baller , B. Bambah , F. Barao , G. Barenboim , P. Barham Alzás , G. J. Barker , W. Barkhouse , C. Barnes , G. Barr , J. Barranco Monarca , A. Barros , N. Barros , J. L. Barrow , A. Basharina-Freshville , A. Bashyal , V. Basque , C. Batchelor , J. B. R. Battat , F. Battisti , F. Bay , M. C. Q. Bazetto , J. L. L. Bazo Alba , J. F. Beacom , E. Bechetoille , B. Behera , E. Belchior , L. Bellantoni , G. Bellettini , V. Bellini , O. Beltramello , N. Benekos , C. Benitez Montiel , D. Benjamin , F. Bento Neves , J. Berger , S. Berkman , P. Bernardini , R. M. Berner , A. Bersani , S. Bertolucci , M. Betancourt , A. Betancur Rodríguez , A. Bevan , Y. Bezawada , A. T. Bezerra , T. J. Bezerra , J. Bhambure , A. Bhardwaj , V. Bhatnagar , M. Bhattacharjee , M. Bhattacharya , D. Bhattarai , S. Bhuller , B. Bhuyan , S. Biagi , J. Bian , M. Biassoni , K. Biery , B. Bilki , M. Bishai , V. Bisignani , A. Bitadze , A. Blake , F. D. Blaszczyk , G. C. Blazey , D. Blend , E. Blucher , J. Boissevain , S. Bolognesi , T. Bolton , L. Bomben , M. Bonesini , C. Bonilla-Diaz , F. Bonini , A. Booth , F. Boran , S. Bordoni , A. Borkum , N. Bostan , P. Bour , D. Boyden , J. Bracinik , D. Braga , D. Brailsford , A. Branca , A. Brandt , M. Bravo-Moreno , J. Bremer , C. Brew , S. J. Brice , C. Brizzolari , C. Bromberg , J. Brooke , A. Bross , G. Brunetti , M. Brunetti , N. Buchanan , H. Budd , J. Buergi , G. Caceres V. , I. Cagnoli , T. Cai , D. Caiulo , R. Calabrese , P. Calafiura , J. Calcutt , M. Calin , L. Calivers , S. Calvez , E. Calvo , A. Caminata , D. Caratelli , D. Carber , J. C. Carceller , G. Carini , B. Carlus , M. F. Carneiro , P. Carniti , I. Caro Terrazas , H. Carranza , N. Carrara , L. Carroll , T. Carroll , A. Carter , J. F. Castaño Forero , A. Castillo , E. Catano-Mur , C. Cattadori , F. Cavalier , G. Cavallaro , F. Cavanna , S. Centro , G. Cerati , A. Cervelli , A. Cervera Villanueva , K. Chakraborty , M. Chalifour , A. Chappell , E. Chardonnet , N. Charitonidis , A. Chatterjee , S. Chattopadhyay , H. Chen , M. Chen , Y. Chen , Z. Chen , Z. Chen-Wishart , Y. Cheon , D. Cherdack , C. Chi , S. Childress , R. Chirco , A. Chiriacescu , N. Chitirasreemadam , K. Cho , S. Choate , D. Chokheli , P. S. Chong , B. Chowdhury , A. Christensen , D. Christian , G. Christodoulou , A. Chukanov , M. Chung , E. Church , V. Cicero , D. Clapa , P. Clarke , G. Cline , T. E. Coan , A. G. Cocco , J. A. B. Coelho , A. Cohen , J. Collot , E. Conley , J. M. Conrad , M. Convery , S. Copello , P. Cova , C. Cox , L. Cremaldi , L. Cremonesi , J. I. Crespo-Anadón , M. Crisler , E. Cristaldo , J. Crnkovic , G. Crone , R. Cross , A. Cudd , C. Cuesta , Y. Cui , D. Cussans , J. Dai , O. Dalager , R. Dallavalle , H. da Motta , Z. A. Dar , R. Darby , L. Da Silva Peres , C. David , Q. David , G. S. Davies , S. Davini , J. Dawson , K. De , S. De , R. De Aguiar , P. De Almeida , P. Debbins , I. De Bonis , M. P. Decowski , A. de Gouvêa , P. C. De Holanda , I. L. De Icaza Astiz , A. Deisting , P. De Jong , A. De la Torre , A. Delbart , V. De Leo , D. Delepine , M. Delgado , A. Dell'Acqua , N. Delmonte , P. De Lurgio , J. R. T. de Mello Neto , D. M. DeMuth , S. Dennis , C. Densham , P. Denton , G. W. Deptuch , A. De Roeck , V. De Romeri , G. De Souza , J. P. Detje , R. Devi , R. Dharmapalan , M. Dias , J. S. Díaz , F. Díaz , F. Di Capua , A. Di Domenico , S. Di Domizio , S. Di Falco , L. Di Giulio , P. Ding , L. Di Noto , E. Diociaiuti , C. Distefano , R. Diurba , M. Diwan , Z. Djurcic , D. Doering , S. Dolan , F. Dolek , M. J. Dolinski , D. Domenici , L. Domine , S. Donati , Y. Donon , S. Doran , D. Douglas , A. Dragone , F. Drielsma , L. Duarte , D. Duchesneau , K. Duffy , K. Dugas , P. Dunne , B. Dutta , H. Duyang , O. Dvornikov , D. A. Dwyer , A. S. Dyshkant , M. Eads , A. Earle , D. Edmunds , J. Eisch , L. Emberger , P. Englezos , A. Ereditato , T. Erjavec , C. O. Escobar , J. J. Evans , E. Ewart , A. C. Ezeribe , K. Fahey , L. Fajt , A. Falcone , M. Fani' , C. Farnese , Y. Farzan , D. Fedoseev , J. Felix , Y. Feng , E. Fernandez-Martinez , F. Ferraro , L. Fields , P. Filip , A. Filkins , F. Filthaut , R. Fine , G. Fiorillo , M. Fiorini , V. Fischer , R. S. Fitzpatrick , W. Flanagan , B. Fleming , R. Flight , S. Fogarty , W. Foreman , J. Fowler , J. Franc , D. Franco , J. Freeman , J. Fried , A. Friedland , S. Fuess , I. K. Furic , K. Furman , A. P. Furmanski , A. Gabrielli , A. Gago , H. Gallagher , A. Gallas , A. Gallego-Ros , N. Gallice , V. Galymov , E. Gamberini , T. Gamble , F. Ganacim , R. Gandhi , S. Ganguly , F. Gao , S. Gao , D. Garcia-Gamez , M. Á. García-Peris , S. Gardiner , D. Gastler , A. Gauch , J. Gauvreau , P. Gauzzi , G. Ge , N. Geffroy , B. Gelli , A. Gendotti , S. Gent , L. Gerlach , Z. Ghorbani-Moghaddam , P. Giammaria , T. Giammaria , N. Giangiacomi , D. Gibin , I. Gil-Botella , S. Gilligan , A. Gioiosa , S. Giovannella , C. Girerd , A. K. Giri , D. Gnani , O. Gogota , M. Gold , S. Gollapinni , K. Gollwitzer , R. A. Gomes , L. V. Gomez Bermeo , L. S. Gomez Fajardo , F. Gonnella , D. Gonzalez-Diaz , M. Gonzalez-Lopez , M. C. Goodman , O. Goodwin , S. Goswami , C. Gotti , J. Goudeau , E. Goudzovski , C. Grace , R. Gran , E. Granados , P. Granger , C. Grant , D. Gratieri , P. Green , S. Greenberg , L. Greenler , J. Greer , J. Grenard , W. C. Griffith , F. T. Groetschla , M. Groh , K. Grzelak , W. Gu , V. Guarino , M. Guarise , R. Guenette , E. Guerard , M. Guerzoni , D. Guffanti , A. Guglielmi , B. Guo , A. Gupta , V. Gupta , K. K. Guthikonda , P. Guzowski , M. M. Guzzo , S. Gwon , C. Ha , K. Haaf , A. Habig , H. Hadavand , A. Hadef , R. Haenni , L. Hagaman , A. Hahn , J. Haiston , P. Hamacher-Baumann , T. Hamernik , P. Hamilton , J. Han , J. Hancock , F. Happacher , D. A. Harris , J. Hartnell , T. Hartnett , J. Harton , T. Hasegawa , C. Hasnip , R. Hatcher , K. W. Hatfield , A. Hatzikoutelis , C. Hayes , K. Hayrapetyan , J. Hays , E. Hazen , M. He , A. Heavey , K. M. Heeger , J. Heise , S. Henry , M. A. Hernandez Morquecho , K. Herner , V. Hewes , C. Hilgenberg , T. Hill , S. J. Hillier , A. Himmel , E. Hinkle , L. R. Hirsch , J. Ho , J. Hoff , A. Holin , T. Holvey , E. Hoppe , G. A. Horton-Smith , M. Hostert , T. Houdy , A. Hourlier , B. Howard , R. Howell , J. Hoyos Barrios , I. Hristova , M. S. Hronek , J. Huang , R. G. Huang , Z. Hulcher , G. Iles , N. Ilic , A. M. Iliescu , R. Illingworth , G. Ingratta , A. Ioannisian , B. Irwin , L. Isenhower , M. Ismerio Oliveira , R. Itay , C. M. Jackson , V. Jain , E. James , W. Jang , B. Jargowsky , F. Jediny , D. Jena , Y. S. Jeong , C. Jesús-Valls , X. Ji , J. Jiang , L. Jiang , A. Jipa , J. H. Jo , F. R. Joaquim , W. Johnson , B. Jones , R. Jones , N. Jovancevic , M. Judah , C. K. Jung , T. Junk , Y. Jwa , M. Kabirnezhad , A. Kaboth , I. Kadenko , I. Kakorin , A. Kalitkina , D. Kalra , O. Kamer Koseyan , F. Kamiya , D. M. Kaplan , G. Karagiorgi , G. Karaman , A. Karcher , Y. Karyotakis , S. Kasai , S. P. Kasetti , L. Kashur , I. Katsioulas , N. Kazaryan , E. Kearns , P. Keener , K. J. Kelly , E. Kemp , O. Kemularia , Y. Kermaidic , W. Ketchum , S. H. Kettell , M. Khabibullin , A. Khotjantsev , A. Khvedelidze , D. Kim , B. King , B. Kirby , M. Kirby , J. Klein , J. Kleykamp , A. Klustova , T. Kobilarcik , K. Koehler , L. W. Koerner , D. H. Koh , S. Kohn , P. P. Koller , L. Kolupaeva , D. Korablev , M. Kordosky , T. Kosc , U. Kose , V. A. Kostelecký , K. Kothekar , I. Kotler , V. Kozhukalov , R. Kralik , L. Kreczko , F. Krennrich , I. Kreslo , W. Kropp , T. Kroupova , M. Kubu , Y. Kudenko , V. A. Kudryavtsev , S. Kuhlmann , S. Kulagin , J. Kumar , P. Kumar , P. Kunze , R. Kuravi , N. Kurita , C. Kuruppu , V. Kus , T. Kutter , J. Kvasnicka , D. Kwak , A. Lambert , B. J. Land , C. E. Lane , K. Lang , T. Langford , M. Langstaff , F. Lanni , O. Lantwin , J. Larkin , P. Lasorak , D. Last , A. Laundrie , G. Laurenti , A. Lawrence , P. Laycock , I. Lazanu , M. Lazzaroni , T. Le , S. Leardini , J. Learned , P. LeBrun , T. LeCompte , C. Lee , V. Legin , G. Lehmann Miotto , R. Lehnert , M. A. Leigui de Oliveira , M. Leitner , L. M. Lepin , S. W. Li , Y. Li , H. Liao , C. S. Lin , S. Lin , D. Lindebaum , R. A. Lineros , J. Ling , A. Lister , B. R. Littlejohn , J. Liu , Y. Liu , S. Lockwitz , T. Loew , M. Lokajicek , I. Lomidze , K. Long , T. Lord , J. M. LoSecco , W. C. Louis , X. -G. Lu , K. B. Luk , B. Lunday , X. Luo , E. Luppi , T. Lux , V. P. Luzio , J. Maalmi , D. MacFarlane , A. A. Machado , P. Machado , C. T. Macias , J. R. Macier , M. MacMahon , A. Maddalena , A. Madera , P. Madigan , S. Magill , K. Mahn , A. Maio , A. Major , K. Majumdar , J. A. Maloney , M. Man , G. Mandrioli , R. C. Mandujano , J. Maneira , L. Manenti , S. Manly , A. Mann , K. Manolopoulos , M. Manrique Plata , V. N. Manyam , M. Marchan , A. Marchionni , W. Marciano , D. Marfatia , C. Mariani , J. Maricic , F. Marinho , A. D. Marino , T. Markiewicz , D. Marsden , M. Marshak , C. M. Marshall , J. Marshall , J. Marteau , J. Martín-Albo , N. Martinez , D. A. Martinez Caicedo , F. Martínez López , P. Martínez Miravé , S. Martynenko , V. Mascagna , K. Mason , A. Mastbaum , F. Matichard , S. Matsuno , J. Matthews , C. Mauger , N. Mauri , K. Mavrokoridis , I. Mawby , R. Mazza , A. Mazzacane , T. McAskill , E. McCluskey , N. McConkey , K. S. McFarland , C. McGrew , A. McNab , A. Mefodiev , P. Mehta , P. Melas , O. Mena , H. Mendez , P. Mendez , D. P. Méndez , A. Menegolli , G. Meng , M. D. Messier , W. Metcalf , M. Mewes , H. Meyer , T. Miao , G. Michna , V. Mikola , R. Milincic , G. Miller , W. Miller , J. Mills , O. Mineev , A. Minotti , O. G. Miranda , S. Miryala , S. Miscetti , C. S. Mishra , S. R. Mishra , A. Mislivec , M. Mitchell , D. Mladenov , I. Mocioiu , K. Moffat , A. Mogan , N. Moggi , R. Mohanta , T. A. Mohayai , N. Mokhov , J. Molina , L. Molina Bueno , E. Montagna , A. Montanari , C. Montanari , D. Montanari , D. Montanino , L. M. Montaño Zetina , S. H. Moon , M. Mooney , A. F. Moor , D. Moreno , L. Morescalchi , D. Moretti , C. Morris , C. Mossey , M. Mote , E. Motuk , C. A. Moura , J. Mousseau , G. Mouster , W. Mu , L. Mualem , J. Mueller , M. Muether , F. Muheim , A. Muir , M. Mulhearn , D. Munford , L. J. Munteanu , H. Muramatsu , J. Muraz , M. Murphy , S. Murphy , J. Musser , J. Nachtman , Y. Nagai , S. Nagu , M. Nalbandyan , R. Nandakumar , D. Naples , S. Narita , A. Nath , A. Navrer-Agasson , N. Nayak , M. Nebot-Guinot , K. Negishi , J. K. Nelson , M. Nelson , J. Nesbit , M. Nessi , D. Newbold , M. Newcomer , H. Newton , R. Nichol , F. Nicolas-Arnaldos , A. Nikolica , J. Nikolov , E. Niner , K. Nishimura , A. Norman , A. Norrick , P. Novella , J. A. Nowak , M. Oberling , J. P. Ochoa-Ricoux , A. Olivier , A. Olshevskiy , Y. Onel , Y. Onishchuk , J. Ott , L. Pagani , G. Palacio , O. Palamara , S. Palestini , J. M. Paley , M. Pallavicini , C. Palomares , S. Pan , W. Panduro Vazquez , E. Pantic , V. Paolone , V. Papadimitriou , R. Papaleo , A. Papanestis , S. Paramesvaran , S. Parke , E. Parozzi , S. Parsa , Z. Parsa , S. Parveen , M. Parvu , D. Pasciuto , S. Pascoli , L. Pasqualini , J. Pasternak , J. Pater , C. Patrick , L. Patrizii , R. B. Patterson , S. J. Patton , T. Patzak , A. Paudel , L. Paulucci , Z. Pavlovic , G. Pawloski , D. Payne , V. Pec , S. J. M. Peeters , A. Pena Perez , E. Pennacchio , A. Penzo , O. L. G. Peres , Y. F. Perez Gonzalez , L. Pérez-Molina , C. Pernas , J. Perry , D. Pershey , G. Pessina , G. Petrillo , C. Petta , R. Petti , V. Pia , F. Piastra , L. Pickering , F. Pietropaolo , V. L. Pimentel , G. Pinaroli , K. Plows , R. Plunkett , T. Pollman , F. Pompa , X. Pons , N. Poonthottathil , F. Poppi , S. Pordes , J. Porter , M. Potekhin , R. Potenza , B. V. K. S. Potukuchi , J. Pozimski , M. Pozzato , S. Prakash , T. Prakash , C. Pratt , M. Prest , F. Psihas , D. Pugnere , X. Qian , J. L. Raaf , V. Radeka , J. Rademacker , R. Radev , B. Radics , A. Rafique , E. Raguzin , M. Rai , M. Rajaoalisoa , I. Rakhno , A. Rakotonandrasana , L. Rakotondravohitra , R. Rameika , M. A. Ramirez Delgado , B. Ramson , A. Rappoldi , G. Raselli , P. Ratoff , S. Raut , H. Razafinime , R. F. Razakamiandra , E. M. Rea , J. S. Real , B. Rebel , R. Rechenmacher , M. Reggiani-Guzzo , J. Reichenbacher , S. D. Reitzner , H. Rejeb Sfar , A. Renshaw , S. Rescia , F. Resnati , M. Ribas , S. Riboldi , C. Riccio , G. Riccobene , L. C. J. Rice , J. S. Ricol , A. Rigamonti , Y. Rigaut , E. V. Rincón , A. Ritchie-Yates , D. Rivera , R. Rivera , A. Robert , J. L. Rocabado Rocha , L. Rochester , M. Roda , P. Rodrigues , M. J. Rodriguez Alonso , J. Rodriguez Rondon , E. Romeo , S. Rosauro-Alcaraz , P. Rosier , M. Rossella , M. Rossi , M. Ross-Lonergan , J. Rout , P. Roy , A. Rubbia , C. Rubbia , G. Ruiz Ferreira , B. Russell , D. Ruterbories , A. Rybnikov , A. Saa-Hernandez , R. Saakyan , S. Sacerdoti , N. Sahu , P. Sala , N. Samios , O. Samoylov , M. C. Sanchez , V. Sandberg , D. A. Sanders , D. Sankey , D. Santoro , N. Saoulidou , P. Sapienza , C. Sarasty , I. Sarcevic , I. Sarra , G. Savage , V. Savinov , G. Scanavini , A. Scaramelli , A. Scarff , A. Scarpelli , T. Schefke , H. Schellman , S. Schifano , P. Schlabach , D. Schmitz , A. W. Schneider , K. Scholberg , A. Schukraft , E. Segreto , A. Selyunin , C. R. Senise , J. Sensenig , D. Sgalaberna , M. H. Shaevitz , S. Shafaq , F. Shaker , M. Shamma , P. Shanahan , R. Sharankova , H. R. Sharma , R. Sharma , R. Kumar , K. Shaw , T. Shaw , K. Shchablo , C. Shepherd-Themistocleous , A. Sheshukov , W. Shi , S. Shin , I. Shoemaker , D. Shooltz , R. Shrock , J. Silber , L. Simard , J. Sinclair , G. Sinev , Jaydip Singh , J. Singh , L. Singh , P. Singh , V. Singh , S. Singh Chauhan , R. Sipos , G. Sirri , A. Sitraka , K. Siyeon , K. Skarpaas , E. Smith , P. Smith , J. Smolik , M. Smy , E. L. Snider , P. Snopok , D. Snowden-Ifft , M. Soares Nunes , H. Sobel , M. Soderberg , S. Sokolov , C. J. Solano Salinas , S. Söldner-Rembold , S. R. Soleti , N. Solomey , V. Solovov , W. E. Sondheim , M. Sorel , A. Sotnikov , J. Soto-Oton , A. Sousa , K. Soustruznik , F. Spagliardi , M. Spanu , J. Spitz , N. J. C. Spooner , K. Spurgeon , D. Stalder , M. Stancari , L. Stanco , J. Steenis , R. Stein , H. M. Steiner , A. F. Steklain Lisbôa , A. Stepanova , J. Stewart , B. Stillwell , J. Stock , F. Stocker , T. Stokes , M. Strait , T. Strauss , L. Strigari , A. Stuart , J. G. Suarez , J. Subash , A. Surdo , V. Susic , L. Suter , C. M. Sutera , K. Sutton , Y. Suvorov , R. Svoboda , S. K. Swain , B. Szczerbinska , A. M. Szelc , A. Taffara , N. Talukdar , J. Tamara , H. A. Tanaka , S. Tang , N. Taniuchi , B. Tapia Oregui , A. Tapper , S. Tariq , E. Tarpara , N. Tata , E. Tatar , R. Tayloe , A. M. Teklu , P. Tennessen , M. Tenti , K. Terao , F. Terranova , G. Testera , T. Thakore , A. Thea , A. Thompson , C. Thorn , S. C. Timm , V. Tishchenko , N. Todorović , L. Tomassetti , A. Tonazzo , D. Torbunov , M. Torti , M. Tortola , F. Tortorici , N. Tosi , D. Totani , M. Toups , C. Touramanis , R. Travaglini , J. Trevor , S. Trilov , W. H. Trzaska , Y. Tsai , Y. -T. Tsai , Z. Tsamalaidze , K. V. Tsang , N. Tsverava , S. Z. Tu , S. Tufanli , C. Tull , J. Turner , M. Tuzi , J. Tyler , E. Tyley , M. Tzanov , L. Uboldi , M. A. Uchida , J. Urheim , T. Usher , H. Utaegbulam , S. Uzunyan , M. R. Vagins , P. Vahle , S. Valder , G. A. Valdiviesso , E. Valencia , R. Valentim , Z. Vallari , E. Vallazza , J. W. F. Valle , S. Vallecorsa , R. Van Berg , R. G. Van de Water , D. Vanegas Forero , D. Vannerom , F. Varanini , D. Vargas Oliva , G. Varner , S. Vasina , N. Vaughan , K. Vaziri , J. Vega , S. Ventura , A. Verdugo , S. Vergani , M. A. Vermeulen , M. Verzocchi , M. Vicenzi , H. Vieira de Souza , C. Vignoli , C. Vilela , B. Viren , A. Vizcaya-Hernandez , T. Vrba , Q. Vuong , T. Wachala , A. V. Waldron , M. Wallbank , T. Walton , H. Wang , J. Wang , L. Wang , M. H. L. S. Wang , X. Wang , Y. Wang , Y. Wang , K. Warburton , D. Warner , M. O. Wascko , D. Waters , A. Watson , K. Wawrowska , P. Weatherly , A. Weber , M. Weber , H. Wei , A. Weinstein , D. Wenman , M. Wetstein , J. Whilhelmi , A. White , A. White , L. H. Whitehead , D. Whittington , M. J. Wilking , A. Wilkinson , C. Wilkinson , Z. Williams , F. Wilson , R. J. Wilson , W. Wisniewski , J. Wolcott , J. Wolfs , T. Wongjirad , A. Wood , K. Wood , E. Worcester , M. Worcester , M. Wospakrik , K. Wresilo , C. Wret , S. Wu , W. Wu , W. Wu , M. Wurm , J. Wyenberg , Y. Xiao , I. Xiotidis , B. Yaeggy , N. Yahlali , E. Yandel , G. Yang , K. Yang , T. Yang , A. Yankelevich , N. Yershov , K. Yonehara , Y. S. Yoon , T. Young , B. Yu , H. Yu , H. Yu , J. Yu , Y. Yu , W. Yuan , R. Zaki , J. Zalesak , L. Zambelli , B. Zamorano , A. Zani , L. Zazueta , G. P. Zeller , J. Zennamo , K. Zeug , C. Zhang , S. Zhang , Y. Zhang , M. Zhao , E. Zhivun , E. D. Zimmerman , S. Zucchelli , J. Zuklin , V. Zutshi , R. Zwaska
In this work, we present an extension of Gaussian process (GP) models with sophisticated parallelization and GPU acceleration. The parallelization scheme arises naturally from the modular computational structure w.r.t. datapoints in the…
Distributed, Parallel, and Cluster Computing · Computer Science
2014-10-21
Zhenwen Dai , Andreas Damianou , James Hensman , Neil Lawrence
We present the extension of the Tinker-HP package (Lagard\`ere et al., Chem. Sci., 2018,9, 956-972) to the use of Graphics Processing Unit (GPU) cards to accelerate molecular dynamics simulations using polarizable many-body force fields.…
Computational Physics · Physics
2021-04-15
Olivier Adjoua , Louis Lagardère , Luc-Henri Jolly , Arnaud Durocher , Thibaut Very , Isabelle Dupays , Zhi Wang , Théo Jaffrelot Inizan , Frédéric Célerse , Pengyu Ren , Jay W. Ponder , Jean-Philip Piquemal
In this work we develop a methodology to approximate the covariance matrix associated to the simulation of water diffusion inside the brain tissue. The computation is based on an implementation of the Discontinuous Galerkin method of the…
Numerical Analysis · Mathematics
2019-07-16
Daniel Cervantes , Miguel angel Moreles , Joaquin Peña , Alonso Ramirez-Manzanares
The Monte Carlo method is a powerful technique for computing thermodynamic magnetic states of otherwise unsolvable spin Hamiltonians, but the method becomes computationally prohibitive with increasing number of spins and the simulation of…
We present in this paper our work regarding simulating a type of P system known as a spiking neural P system (SNP system) using graphics processing units (GPUs). GPUs, because of their architectural optimization for parallel computations,…
Distributed, Parallel, and Cluster Computing · Computer Science
2011-04-13
Francis Cabarle , Henry Adorna , Miguel A. Martinez-del-Amor
Massively parallel simulations of relativistic fluid dynamics on graphics processing units with CUDA
Relativistic fluid dynamics is a major component in dynamical simulations of the quark-gluon plasma created in relativistic heavy-ion collisions. Simulations of the full three-dimensional dissipative dynamics of the quark-gluon plasma with…
This paper presents the benchmarking and scaling studies of a GPU accelerated three dimensional compressible magnetohydrodynamic code. The code is developed keeping an eye to explain the large and intermediate scale magnetic field…
Computational Physics · Physics
2019-01-25
Rupak Mukherjee , Rajaraman Ganesh , Vinod Saini , Udaya Maurya , Nagavijayalakshmi Vydyanathan , Bharatkumar Sharma
Palabos-npFEM is a computational framework for the simulation of blood flow with fully resolved constituents. The software resolves the trajectories and deformed state of blood cells, such as red blood cells and platelets, and the complex…
Smoothed Dissipative Particle Dynamics (SDPD) is a mesoscopic method which allows to select the level of resolution at which a fluid is simulated. The aim of this work is to extend SDPD to chemically reactive systems.To this end, an…